Ο Νίκος Θυμάκης εργάστηκε σε 3 διαφορετικούς Δήμους της Περιφέρειας Αττικής μεταξύ 2000 και 2020, σε προάστια της Αθήνας, ως Επικεφαλής Τμημάτων Πάρκων και Κήπων  , Σύμβουλος για το Αστικό Πράσινο  και τα προγράμματα της ΕΕ (LIFE, H2020, Erasmus) ενώ διετέλεσε ειδικός επιστημονικός σύμβουλος της Ανθοκομικής Έκθεσης Κηφισιάς από το 2004 ως το 2012 . Υπηρέτησε επίσης στη ΣΑΕΚ ΑΤΤΙΚΗΣ του ΕΛΓΟ ΔΗΜΗΤΡΑ ως Διευθυντής  και το Ινστιτούτο Γεωπονικών Επιστημών ως Πρόεδρος. Ως Επίτιμος Πρόεδρος της Ένωσης Ελλήνων Εξαγωγέων και Εισαγωγέων Φυτικού Υλικού (ΕΣΕΕΦΥ) εκπροσωπεί την Ελλάδα στην Ευρωπαϊκή Ένωση  Φυτωριούχων (ENA) και τη Διεθνή Ένωση Φυτωριούχων (AIPH). Εργάστηκε επίσης στο Κατάρ, την Τουρκία, τη Σαουδική Αραβία, την Κύπρο, την Ολλανδία, τη Βουλγαρία, τη Γαλλία, τη Ν. Κορέα και την Ταϊβάν, προωθώντας τον αυτοσυντηρούμενο «Ελληνικό Κήπο» (βασισμένο στην Ελληνική Χλωρίδα και εμπνευσμένο από τον Βαλκανικό Βοτανικό Κήπο Κρουσίων) παγκοσμίως με τις δραστηριότητές του και ως Ειδικός Κηποτέχνης,   Σύμβουλος σε Ιστορικούς Κήπους και Πάρκα, και Ειδικός στη Διαχείριση Φοινικοειδών. 

Kontodimas D.C., Economou D., Thymakis N., Menti Ch. and Anagnou-Veroniki M., (2006), “New serious pest of palm trees, the coleopterous Rhynchophorus ferrugineus Olivier” AGRICULTURE-CROP &ANIMAL HUSBANDRY, Vol 1/2006, Athens, p. 54-57 

Kontodimas D.C., Milonas P.G., Vassiliou V., Thymakis N. and Economou D., (2006), “The occurrence of Rhynchophorus ferrugineus Olivier in Greece and Cyprus and the risk against the native greek palm tree Phoenix theophrasti Greuter”, ENTOMOLOGIA HELLENICA, Vol 16, Athens, p. 11-15  

Thymakis N, (2009) “Phoenix theophrasti Greuter”, RED DATA BOOK OF GREECE, VOL II, Patras, p.256-258 

Thymakis N, Georgi N.J, Sarikou S., (2005), “The growth of Palms under sheltered Mediterranean conditions”, PALMS, IPS Vol49(4) , Lawrence Kansas, p. 189-194 

Thymakis N., (2003) “The Cretan Date Palm” (Phoenix theophrasti Greuter), The Mediterranean Gardener magazine, Vol 32, MGS editions, Peania, p. 32-34  

Thymakis N., (2003) “The use of palms in Greece” The Mediterranean Gardener magazine, Vol 33, MGS editions, Peania, p. 54-55  

Athanasiadou E. & Thymakis N. (2018.) Historic gardens, parks, and landscapes in Greece. Echopolis 2018. Nature and culture –based strategies and solutions for cities and territories: an idea whose time has come! 26-28 November 2018, Athens, Greece.  

Thymakis N.& Tzortzi G. (2021), “The Hellenic Garden. A worldwide brand of climate wise cultural landscaping approach in urban spaces”, SURE, 5-7 July 2021, Poznan, Poland  

Thymakis N., (2022), “The Monastic Byzantine Garden as a Form of Ecological Worship in the Balkans,” Mapping Eastern Europe, eds. M. A. Rossi and A. I. Sullivan, accessed November 18, 2022, https://mappingeasterneurope.princeton.edu.  

Thymakis. N, (2023) “The Pikionic Landscape of Philopappos Hill and other stories of Botanical Gardens, Historical Parks, and Gardens in Greece. An overview, with a look at their future role in cultural heritage”, IV Forum “A Europe of United Gardens” of European Route of Historic Gardens and Parks, Florence-Green Herald Issue 2. 

Maknea. I.K, Thymakis. N, Tzortzi. J, Asanica. A.C. (2024), “Citizens and Urban Horticulture Relationship after Covid-19 Pandemic: Facts from Romania, Greece and Cyprus”, AGRILIFE, 6-8 June 2024, Bucharest, Romania.